なんか読めば読むほど分からない質問ですね。

オークランドのエージェントに通っているのはなぜ？
そこでは教えてくれないんですか？

ご返信ありがとうございます。
エージェントに頼るのは初なのでご理解いただけない部分お許しください。

ニュージーランドにあるエージェントだからと言って何もニュージーランドのビザだけについてエージェントは答えられると言うことではないのですか？

つまりオーストラリアのビザの件も委託しても良いと言うことでしょうか？

エージェント、と言うのはイミグレーション アドバイザーの事ですか？

オーストラリアのビザを取るのであればオーストラリアのイミグレのアドバイザーを探して話しするべきだと思います。今はメールでもスカイプでも出来ますし。

ただ、費用もかかるのでオーストラリアのイミグレのサイトを見てステップ通りに進めればワーホリビザは難しくないと思いますが…

インターネット環境があれば、エージェントを使わなくても自分でできますよ。オーストラリアイミグレーションのウェブサイトです。
https://online.immi.gov.au/lusc/login

日本語で解説してあるサイトもみつけたので、下にリンク張ります。
http://blog.aus-ryugaku.com/first-working-holiday-visa-application-guide/

すべて、日本語解説してあるようなので、この通りやれば、申請料のみで自分で取れると思いますよ。
がんばってください。