この件は、AA、警察、Land Transport NZに問い合わせても、いまひとつハッキリとしません。

ただ、トピ主さんの言う「50㏄原付バイク」を、スクーター又はモペットとするならば、法的に認められる最高時速は50㎞/hです。
スクーター・モペットには、特別な運転免許や定期的なWOFは必要ありません。
ところが、モーターウェイには、実は最低速度（渋滞などの場合を除く）があり、それが80㎞/h（警察官に確認）なのだそうです。
渋滞していないモーターウェイを、50キロ走行していたら罰金です。

そうすると、スクーターではハーバーブリッジは走行不可という事になります。
実際、50㏄の原付は50㎞/h以上のスピードが出ますが、NZの法律ではダメなんです。
原付でも、50㎞/h以上のスピードで走るとすると、モーターバイクと認識されるので、定期的なWOFと、モーターバイクの運転免許も必要になります。

トピ主さんが、NZのモーターバイク免許をお持ちで、原付をモーターバイクとして登録し、WOFを受けていれば、モーターウェイの走行に何も問題はありません。

曖昧なのですが、モーターウェイをスクーター（例：50㏄原付）で走行してはいけないという決まりはありませんが、スクーターは50㎞/h以上のスピードを出してはいけない、という決まりと、モーターウェイを時速50キロで走っていけない（渋滞時などは除く）決まりはある、という事になります。

だとすると、確実に渋滞している時間帯のノロノロ運転のハーバーブリッジなら大丈夫、という事になるのかもしれませんが...

だめです。
速度が遅いため、警察がいたらアウトです。
それでも使っている人は何度も見かけています。